Os répteis são o grupo que reúnem o menor número de espécies da região do litoral paranaense, cerca de 50, representando 32,47% do ocorre no Estado. Aqui são encontradas cobras peçonhentas, como a cobra-coral e a jararaca, e não peçonhentas, como a cobra-d’água, a dormideira e a caninana.

A cobra cega, embora parece uma serpente, na erdade é um lagarto sem pernas. O lagarto Teiú é muito comum nos campos e nas bordas das florestas, bem como as lagartixas dentro de casa. O jacaré-de-papo-amarelo pode ser encontrado nas bordas das baías, embora seja mais característico dos cursos d´água mais interiores, tanto no continente, quanto nas ilhas.

A região é frequentada por cinco das sete espécies de tartarugas marinhas conhecidas: a tataruga verde, a cabeçuda, a de pente, a oliva e a de couro.